嘉興市區城市防洪工程按照“防洪100年一遇，排澇20年一遇”標準設計，防洪區域規劃總面積127.1km2，目前建成104.09 km2，投入建設資金4.1億元。有穆湖溪、三店塘、平湖塘、海鹽塘、長水塘五大樞紐，共安裝22臺水泵，設計總排澇流量240m3/s，并建有53座節制閘、54.4km防洪堤和50萬m2綠化。市區城市防洪工程自建成以來成功防汛防臺100余次，弘揚“求真務實”精神，牢牢把握事前防控理念，2019年“利奇馬”和2021年“煙花”兩次臺風均啟動一級響應，始終保持市區安全水位，安全度汛、穩固防線，有力保障了城區人民生命財產和安居樂業的美好環境安全。長水塘樞紐具有雙向排水功能，在旱期市區水位過低時，開啟長水塘泵站向內生態引水，保持市內河道美麗，展現水清河暢風貌。

公司分別于2009年和2013年，在市區兩座水廠前端建成新塍塘(石臼漾)水源濕地、長水塘（貫涇港）水源濕地，承擔市區千家萬戶的飲用水凈化供給任務，通過生物處理技術，構建區域生態水網，優化水資源配置格局，為水廠提供更優質的水源，提高飲用水質量，目前濕地出水水質常年穩定在三類水，進一步提升了水廠取水安全的能力。石臼漾水源生態濕地在2013年榮獲聯合國人居署“全球百佳范例”稱號。石臼漾、貫涇港兩個飲用水水源地在2020年、2021年連續被評為省級“優秀”水源地。

南湖生態環境修復工程，采用“先水養草，后草養水”的生態修復方式：一是先水養草實現入水降濁提質；二是后草養水實現水域自凈體系，實現了南湖區域“水清景美”的生態系統，目前已建成投入運行。南湖湖區沉水植物覆蓋率達到25%，整體透明度達到80厘米以上，水質穩定達到湖庫Ⅲ類標準。南湖生態環境修復項目也因此入選第一批浙江省“五水共治”實踐窗口和國家級報刊中國環境報“十四五”生態環境創新工程百佳案例。

九水水環境生態修復工程，著力改善河網水環境質量，降低河道懸浮物，提高水體透明度，使河網水生態系統完整性得到提升。公司從單一的水利工程建設管理到“水利+水生態+水環境建設”的復合型管理企業發展。